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　オオミズナギドリは小笠原海域ではほぼ見られなくなる。替わってオナガミズナギドリが主になる。オナガミズナギドリは上面から見るとほぼ黒く見える。光線状態によっては少し茶色気味にも見える。嘴は薄い灰色に見え先端だけが黒い。また、飛翔中、オナガミズナギドリは尾が細長く先が尖り気味だが、オオミズナギドリは幅広気味で先も尖っていない。顔を中心とした頭部が、オオミズナギドリはまだら模様だが、オナガミズナギドリは一様に暗い灰色である。